一種生產(chǎn)發(fā)酵產(chǎn)品的方法,包括以下步驟:(i)形成一種微粒狀的植物來源材料的酸化懸浮液,其包括較易于水解的第一多糖和較難于水解的第二多糖,(ii)使第一多糖在至少為50℃的溫度下在一些條件下通過酸的作用下進行水解,使得第一多糖被水解,并由此形成一種包含溶解的糖和含有第二多糖的固體殘渣的水性液體的混合物,(iii)使該混合物經(jīng)歷一個或多個分離階段,從而使固體殘渣和水性糖液基本上彼此分離,(iv)任選地洗滌基本上不含酸和糖的殘渣,(v)讓固體纖維素殘渣經(jīng)歷進一步的處理階段,其中使殘渣在至少為50℃的溫度下在一些條件下經(jīng)受稀酸的作用使得第二多糖被水解,由此形成含有溶解的糖和固體殘渣的水性液體的混合物,(vi)使該混合物經(jīng)受一個或多個分離階段,從而使固體殘渣和水性糖液基本上彼此分離,(vii)任選地洗滌基本上不含糖的殘渣,(viii)將步驟(iii)、(iv)、(vi)和(vii)中水性液體的pH調(diào)節(jié)到至少為4,(ix)讓步驟(viiii)中得到的水性液體經(jīng)歷發(fā)酵階段以制備發(fā)酵產(chǎn)品,(x)從發(fā)酵液中分離發(fā)酵產(chǎn)品,其中步驟(iii)和/或(vi)中的分離階段受助于廢棄副產(chǎn)物的絮凝作用,使用一種或多種選自水溶性聚合物、水可膨脹的聚合物和帶電微粒材料的絮凝劑。典型地,這樣的發(fā)酵產(chǎn)品包括例如乙醇、丙三醇、丙酮、正丁醇、丁二醇、異丙醇、丁酸、甲烷、檸檬酸、富馬酸、乳酸、丙酸、琥珀酸、衣康酸、醋酸、乙醛、3-羥基丙酸、葡糖酸、酒石酸和氨基酸如L-戊二酸、L-賴氨酸、L-天冬氨酸、L-色氨酸、L-芳基甘氨酸及其鹽。