本發(fā)明涉及一種有機(jī)基質(zhì)魚菜分離共生的混合種植養(yǎng)殖系統(tǒng)，包括水產(chǎn)養(yǎng)殖區(qū)、基質(zhì)處理區(qū)和種植區(qū)，其中：水產(chǎn)養(yǎng)殖區(qū)包括魚池、多級沉淀分離裝置和硝化床；魚池中的養(yǎng)殖廢水進(jìn)入多級沉淀分離裝置進(jìn)行過濾，沉淀分離出的固體有機(jī)物進(jìn)入基質(zhì)處理區(qū)進(jìn)行處理，過濾后的清水進(jìn)入硝化床進(jìn)行硝化處理，經(jīng)硝化床硝化處理后的凈水分別流入魚池和種植區(qū)；基質(zhì)處理區(qū)產(chǎn)生的種植基質(zhì)進(jìn)入種植區(qū)，種植期結(jié)束后，種植區(qū)產(chǎn)生的廢舊種植基質(zhì)再排入基質(zhì)處理區(qū)進(jìn)行處理。本發(fā)明提高了植物種植的產(chǎn)量和質(zhì)量，解決了水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)內(nèi)水的營養(yǎng)濃度過度和鹽類富集的問題，降低了硝化基質(zhì)的投入成本，降低了魚菜共生系統(tǒng)構(gòu)建成本，實(shí)現(xiàn)了可持續(xù)發(fā)展的水產(chǎn)和種植生產(chǎn)模式。