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基于異質(zhì)圖的藥物-蛋白質(zhì)靶向作用預(yù)測(cè)方法

1072   編輯:管理員   來(lái)源:中冶有色技術(shù)網(wǎng)  
2023-03-19 07:29:10
本發(fā)明公開(kāi)一種基于異質(zhì)圖的藥物?蛋白質(zhì)靶向作用預(yù)測(cè)方法,包括:S1.通過(guò)獲取來(lái)自Drugbank、SIDER等數(shù)據(jù)庫(kù)的藥物,靶點(diǎn)以及疾病等信息,與已有的公開(kāi)數(shù)據(jù)集進(jìn)行匹配整合,構(gòu)建藥物和靶點(diǎn)相關(guān)的異質(zhì)圖,并通過(guò)RDKit計(jì)算和基于成對(duì)的Smith?waterman得分獲得藥物化學(xué)結(jié)構(gòu)信息和蛋白質(zhì)序列信息。S2.結(jié)合節(jié)點(diǎn)表示與圖級(jí)表示之間的互信息以及子結(jié)構(gòu)表示與圖級(jí)表示之間的互信息,從異構(gòu)信息中學(xué)習(xí)精確的和可解釋的特征嵌入,提出了一個(gè)端到端的多視圖自動(dòng)編碼器模型完成鏈路預(yù)測(cè)的任務(wù)。本發(fā)明對(duì)于藥物重定向具有有益的科學(xué)指導(dǎo)作用,有利于發(fā)現(xiàn)潛在的藥物?蛋白質(zhì)靶點(diǎn)有效鏈接,加快舊藥新用的節(jié)奏。
聲明:
“基于異質(zhì)圖的藥物-蛋白質(zhì)靶向作用預(yù)測(cè)方法” 該技術(shù)專(zhuān)利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請(qǐng)聯(lián)系該技術(shù)所有人。
我是此專(zhuān)利(論文)的發(fā)明人(作者)
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