本發(fā)明涉及一種DNA測(cè)序質(zhì)量分?jǐn)?shù)無(wú)損壓縮方法,采用類(lèi)run-length編碼方法將提取出來(lái)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換:例如,對(duì)于某質(zhì)量分?jǐn)?shù)A連續(xù)出現(xiàn)2次以上相同字符的質(zhì)量分?jǐn)?shù)串,其出現(xiàn)次數(shù)記為n,將該質(zhì)量分?jǐn)?shù)A的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)n的相反數(shù)-n作為該質(zhì)量分?jǐn)?shù)串的長(zhǎng)度值,以便將該質(zhì)量分?jǐn)?shù)串轉(zhuǎn)換為A(-n),并存儲(chǔ)到壓縮文件中,從而壓縮此類(lèi)質(zhì)量分?jǐn)?shù)。本發(fā)明提出了一種特別面向質(zhì)量分?jǐn)?shù)的無(wú)損壓縮方法,降低了單獨(dú)出現(xiàn)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)的編碼量,打破了經(jīng)典的run-length的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),即質(zhì)量分?jǐn)?shù)-長(zhǎng)度對(duì),適應(yīng)性的公開(kāi)了一種新機(jī)制來(lái)對(duì)長(zhǎng)度進(jìn)行變換,使得它與質(zhì)量分?jǐn)?shù)的值域不相交,且壓縮方面具備高效性能。
聲明:
“DNA測(cè)序質(zhì)量分?jǐn)?shù)無(wú)損壓縮方法” 該技術(shù)專(zhuān)利(論文)所有權(quán)利歸屬于技術(shù)(論文)所有人。僅供學(xué)習(xí)研究,如用于商業(yè)用途,請(qǐng)聯(lián)系該技術(shù)所有人。
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